フローソースが以下のNetFlow v9フィールドを使用してポート番号を送信している場合、現在のFlowmonではそれらのフィールドをサポートしていない為、ポート番号を表示できません。

182 tcpSourcePort
183 tcpDestinationPort

Flowmonは、以下の標準フィールドをサポートしていますので、恐れ入りますがフローソース側の設定変更をご検討ください。

7 NF9_L4_SRC_PORT
11 NF9_L4_DST_PORT