Flowmonで期待するレコードが取得できないケースとしては以下が考えられます。
・ネットワーク機器が該当のレコード出力に対応をしておらず、Flow生成が行えない
・Flowmonが該当Flowフィールドに対応しておらず、Flow受信を行うことができない

Flowmonが対応しているFlowフィールド一覧の詳細は、こちらをご参照ください。