Collectorを推奨する理由として、処理性能がCollectorの方が優れているという点もございますが、Probeの機能制限によるところが大きいです。
ProbeはFlow生成専用機となりますが、1TBのストレージも同梱しており、単独でのFlow解析も可能です。
ただし、Probeは1TB以上のストレージはご用意がなく、自身が生成したFlow情報のみしか受信できないため、複数のFlow生成機のトラフィックを集約することができません。
これら制限を考慮すると、長期保存、大規模環境では不向きといえます。