設定ファイルアップロード時のモードによって設定ファイルアップロード後のFlowmonの状態が変わります。

Configuration Center>システム>メンテナンス>設定ファイル>アップロード にて、 設定ファイルを選択し、「アップロード」をクリックすると アップロードする項目を選択する画面が表示され、任意の項目のみをアップロードすることが出来ます。
最下部の「追加設定」にて、「追加して変更」もしくは「削除して作成」が選択できます。
「追加して変更」では対象の機器に元々存在してるソースやプロファイルに加え、設定ファイルに存在するソースやプロファイルが追加されます。 また、対象の機器に既に存在するソースやプロファイルは設定ファイルに従って変更されます。
「削除して作成」では対象機器に元々存在しているソースやプロファイルは一旦全て削除され、設定ファイルに存在するソースやプロファイルが作成されます。 ソースやプロファイルが削除されますと今まで受信したフローデータも削除されますのでご注意ください。
バージョンが異なるFlowmonに設定ファイルをアップロードする場合、保証されているのは前のバージョンの最後の安定版となります。 例えば、バージョン11.0.xからダウンロードされた設定ファイルは、バージョン11.1.yと互換性があります。
xmlファイルを修正し、それをアップロードするとその変更内容が適用されます。